Η Φανή Βοβώνη γεννήθηκε στην Αθήνα. Σπούδασε βιολί στο Κärnten Landeskonservatorium του Klagenfurt με τον Helfried Fister και στο Πανεπιστήμιο Μουσικής και Δραματικής Τέχνης της Βιέννης με τον Ernst Kovacic, όπου και αποφοίτησε με διάκριση. Παράλληλα παρακολούθησε μαθήματα μπαρόκ βιολιού με τον Hiro Kurosaki και τον Reinhard Goebel.
Υπήρξε μέλος της European Union Youth Orchestra (2000) καθώς και της European Union Barock Orchestra (2004, 2006).
Ασχολήθηκε εντατικά με την ιστορική ερμηνεία, τη μοντέρνα μουσική καθώς και με ζητήματα δραματουργίας στη μουσική περφόρμανς.
Ζει στη Βιέννη όπου και συνεργάζεται με σύνολα όπως Klangforum Wien, Camerata Salzburg, Barruco, Concerto Stella Matutina, Il Pomo d’Oro, Black Page Orchestra, Cappela Leopoldina, Ensemble Prisma κ.ά. ενώ έχει λάβει μέρος σε διάφορα Φεστιβάλ στην Ευρώπη, καθώς και στη Βόρεια και Νότια Αμερική.
Παράλληλα έχει τακτική συνεργασία με τα ελληνικά σύνολα παλαιάς μουσικής Ex Silentio και Latinitas Nostra.
Υπό τη σκηνοθεσία του Σάββα Στρούμπου και σε συνεργασία με τη σοπράνο Φανή Αντωνέλου και την ηθοποιό Έλλη Ιγγλίζ ανέβασε το έργο Θραύσματα από τον Κάφκα (Kafka-Fragmente) στο θέατρο Άττις στην Αθήνα το 2018.